L’analisi microbiologica dell’aspirato endotracheale rappresenta una pratica fondamentale dei pazienti intubati ricoverati nell’area critica, ma spesso non riflette le reali caratteristiche della flora che risiede nel polmone profondo. In questo studio la analisi di sequenza sull’RNA estratto ottenuto contemporaneamente da aspirato standard endotracheale e da campione sterile del polmone distale conferma concordanza in termini quantitativi e qualitativi riguardo la popolazione batterica. L’utilizzo routinario della aspirazione endotracheale va pertanto considerato esaustivo ai fini della valutazione clinica sulla popolazione batterica residente nel polmone profondo in questi pazienti.
Background
Gli aspirati endotracheali (ETA) sono ampiamente utilizzati per gli studi microbiologici del tratto respiratorio nei pazienti intubati. Tuttavia, comportano il campionamento attraverso un tubo endotracheale stabilito utilizzando cateteri di aspirazione, entrambi i quali possono acquisire biofilm che possono confondere i risultati.
Scopo della ricerca
L’ETA clinico standard nei pazienti intubati riflette accuratamente l’autentico microbioma batterico delle vie aeree inferiori?
Progettazione e metodi dello studio
È stata applicata una profilazione batterica quantitativa completa utilizzando il sequenziamento del gene 16S rRNA V1-V2 per confrontare le popolazioni batteriche catturate dall’ETA clinico standard rispetto ai campioni gold standard contemporanei acquisiti direttamente dalle vie aeree inferiori attraverso una cannula tracheostomica sterile appena posizionata. Lo studio ha incluso 13 pazienti sottoposti a tracheostomia percutanea dopo intubazione prolungata (mediana, 15 giorni). Ai campioni sono stati applicati parametri di composizione batterica, diversità e quantificazione relativa.
Risultati
Gli ETA pre-tracheostomia somigliavano molto ai microbiomi delle vie aeree immediatamente post-tracheostomia gold standard nella composizione batterica e nelle caratteristiche comunitarie di diversità e quantificazione. Anche i biofilm del tubo endotracheale e del catetere di aspirazione somigliavano alle comunità affini dell’ETA e della tracheostomia fresca.
Interpretazione
Un profilo molecolare imparziale mostra che il campionamento clinico ETA standard ha una buona concordanza con l’autentico microbioma delle vie aeree inferiori nei pazienti intubati.
Tratto da Chest Journal®